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Grisaia Phantom Trigger è il capitolo più recente della popolare serie anime Phantom Trigger. Questo nuovo capitolo si basa sulla serie originale e racconta una storia diversa dai capitoli precedenti.
La storia inizia con le ragazze del capitolo precedente, ma le cose sono ora più complicate poiché il nuovo capitolo introduce più personaggi e nuovi eventi. La storia è raccontata dal punto di vista del personaggio principale, l'androide chiamato Phantom, che è il figlio del personaggio principale del capitolo precedente, Grace.
Phantom è ora in una nuova scuola, dove incontra una nuova amica, l'androide Fumi. Fumi proviene dalla stessa scuola di Phantom, ed è stata scelta dall'organizzazione chiamata SORD (Social Ops, Research & Development). SORD è un'organizzazione segreta anti-terroristica, e lo scopo dell'organizzazione è quello di addestrare una nuova generazione di agenti per difendere il paese dalle future minacce.
